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何种检测方法更有利于成人支气管扩张症病原微生物精准诊断?近日,由中南大学湘雅二医院罗红教授团队联合金域医学(603882)开展的前瞻性研究找到了答案。研究团队首次通过对支气管扩张症成年患者的痰标本同时进行培养和宏基因组二代测序(mNGS:DNA+RNA)检测,发现:在支气管扩张症患者痰液样本中,除铜绿假单胞菌外,检出多种细菌、病毒和真菌,且存在多种病原体混合检出的情况,认为mNGS相较于培养更能有效地帮助患者进行病原学的精准检测。这一结果近日也发表于权威学术期刊《Journal of Infection》(IF:28.2)。

支气管扩张症是一种以气道异常扩张和慢性呼吸道感染为特征的呼吸系统疾病。其病因多样、病情复杂、不同个体之间异质性大且缺乏可预测性。同时,不同的微生物慢性感染对支气管扩张症疾病的进展、气道的炎症和患者的预后有密切关系。

临床上病原微生物的检测多以培养为主。如今,mNGS逐渐被认可并陆续应用于感染性疾病的诊断。但和培养相比,mNGS在支气管扩张症病原微生物检测方面,优势如何?在2020年10月至2022年8月期间,中南大学湘雅二医院招募了59例确诊为支气管扩张症且稳定期有脓痰的成年患者,开展培养和宏基因组二代测序(mNGS:DNA+RNA)检测对照研究。

59例样本mNGS病原检出情况

研究团队在59例支气管扩张症患者中发现,mNGS的细菌阳性率高于培养(100% vs 85.7%)。其中,检出频率较高的细菌有:铜绿假单胞菌(35/59, 59.3%)、流感嗜血杆菌(13/59, 22.0%)、卡他莫拉菌(7/59, 11.9%)、肺炎链球菌(5/59, 8.5%)、金黄色葡萄球菌(5/59,8.5%)、大肠杆菌(3/59, 5.1%)、肺炎克雷伯菌(3/59, 5.1%);检出相对频率较低的细菌有:盖尔森基兴诺卡菌、化脓性链球菌、多噬伯克霍尔德菌、结核分枝杆菌以及星座链球菌。结果表明:除可通过常规培养检测出来的常见细菌外,其他多种常规培养无法检测到的病原体也可以引起支气管扩张症慢性感染,突显了mNGS在支气管扩张患者病原检测中的潜力。

同时,通过mNGS发现14例支气管扩张症患者为多种细菌感染(23.7%),但仅5例患者通过培养诊断为多种细菌感染。这表明在支气管扩张症中存在多种细菌可能比既往认识的更为常见。

10例培养阴性,mNGS检出病原情况以及10例mNGS检出多细菌,培养的结果

另外,相较于常规培养,mNGS在多例患者中检测到丰度较低的白色念珠菌,以及各种类型的病毒,包括人类疱疹病毒1型(HSV1)、EB病毒(EBV)、巨细胞病毒(CMV)、人类疱疹病毒6型(HSV6)、人类疱疹病毒7型(HSV7)、人类乳头瘤病毒、鼻病毒、肠道病毒和人类冠状病毒等。进一步说明,mNGS可一次性检出样本中各种类型的病原体,在患者病原学精准检测上,更具有检测优势。

罗红教授团队肯定了mNGS在支气管扩张症患者的病原检测价值。其认为:mNGS的应用为进一步探索多细菌感染的临床影响,以及真菌和病毒在支气管扩张症中的意义提供了思路。

作为本次研究的参与者,金域医学搭建了全面的感染诊断平台,致力于为临床提供对的检测,而不是贵的检测。针对感染性疾病诊断,金域医学推出tNGS、mNGS检测、传统形态学检验在内的超450项检测项目,为临床提供从筛查到治疗管理的一站式解决方案,有9大mNGS检测中心(广州、长沙、成都、重庆、郑州、广西、杭州、天津、昆明),26大tNGS检测中心。同时,最新推出的MetaCAP其既兼顾mNGS广谱检测和tNGS良好的特异性、灵敏度,又解决组织和无菌体液病原核酸测序痛点,还具备高性价比,是当下病原微生物测序的有力补充,将推动感染性疾病精准诊疗进一步发展。

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